1、产地不同

白瓜子是内蒙古出口的土特产品，主要产于黑龙江和内蒙古地区；南瓜子主要产自山东、河北、江西等地，因为这些省份地区的南瓜产量较大，所以南瓜子的产量也非常丰盛。

2、来源不同

白瓜子其实是一些不同品种的瓜子经过加工制作而成的，可以是用西葫芦里面的籽制作出来的，也可以是用窝瓜或者南瓜里面的籽制作而成；而南瓜子就是用成熟的南瓜里面的籽经过晒干之后制作而成的。

3、颜色不同

白瓜子外表颜色是白色的；南瓜子多为暗黄色，这也是白瓜子和南瓜子最大的区别。

4、上市时节不同

白瓜子的来源多种多样，这些瓜的成熟时节大多数是在夏天，所以夏天是白瓜子大量上市的时节；南瓜一般要到秋天才会成熟，所以南瓜子的上市时节通常是在秋天。