珍珠奶茶喝多了对身体有影响，奶茶中的反式脂肪酸会提高患心血管疾病、糖尿病和老年痴呆症的风险，会影响儿童神经系统发育，还会降低青年人的生育能力。

目前市面上的珍珠奶茶，基本上是用奶精代替奶，用甜蜜素、糖精替代白糖和冰糖，用各式合成果粉代替茶，实际上就是奶精、香精、色素、糖和淀粉珠的混合物，珍珠的成分包括淀粉、焦糖、食用香精、山梨酸钾或者苯甲酸钠，有不同的口味其实是香精的功劳，还添加各种色彩绚丽的色素，制作出草莓、芒果等口味奶茶。

目前国内的奶精是氢化植物油、糊精、少量酪蛋白酸钠、奶油香精、乳化剂、抗结剂等成分组成的混合物，除了口感上和奶相似之外，其他均名不副实，和奶并无任何关联，而是和反式脂肪酸牵扯不清，氢化植物油学名为反式脂肪酸甘油酯，俗名有人造奶油、奶精、植脂、植脂末、植脂奶油、麦淇淋等。