蛋白质的水解程度不同：深度水解配方是将大分子牛奶蛋白水解成短肽及游离氨基酸，深度水解配方相对于适度水解配方水解程度要更高，适度水解配方是将牛奶蛋白水解为小分子蛋白、肽和氨基酸。

深度水解和适度水解奶粉的区别

深度水解奶粉属于医用的特殊奶粉，主要用于缓解程度高的牛奶蛋白过敏，适度水解奶粉大多数属于普通奶粉，用于预防以及缓解轻微的牛奶蛋白过敏。

奶粉是以新鲜牛奶或羊奶为原料，用冷冻或加热的方法，除去乳中几乎全部的水分，干燥后添加适量的维生素、矿物质等加工而成的冲调食品。

婴儿奶粉多是以牛乳作为基本原料再将之“母乳化”而成，也就是尽量模拟人类母乳的成分制作，一般婴儿奶粉吃到一岁左右，都不会有营养缺乏的顾虑。